近日，中國(guó)科學(xué)院微生物研究所趙瑞琳?qǐng)F(tuán)隊(duì)在期刊Fungal Diversity上發(fā)表題名為“Phylogenomics, divergence times and notes of orders in Basidiomycota”的論文。團(tuán)隊(duì)通過(guò)構(gòu)建擔(dān)子菌門(mén)系統(tǒng)演化基因組圖譜，推斷各類(lèi)群的演化時(shí)間等，澄清分類(lèi)問(wèn)題，更新了擔(dān)子菌門(mén)的分類(lèi)系統(tǒng)。

擔(dān)子菌門(mén)（Basidiomycota）是真菌界中僅次于子囊菌門(mén)的第二大類(lèi)群，物種超過(guò)4萬(wàn)種，約占已知真菌總物種數(shù)的1/3；包含了絕大多數(shù)食藥用菌、毒蘑菇等大型真菌及銹菌、黑粉菌等重要的植物病原真菌，不僅具有重要的生態(tài)價(jià)值，而且和人類(lèi)經(jīng)濟(jì)活動(dòng)關(guān)系緊密。

分類(lèi)系統(tǒng)承載了生物多樣性信息，并且是相關(guān)信息存儲(chǔ)和快速提取的依托，在生物多樣性研究、保護(hù)和可持續(xù)利用中發(fā)揮關(guān)鍵性的基礎(chǔ)作用。針對(duì)擔(dān)子菌門(mén)的各級(jí)分類(lèi)系統(tǒng)存在相互矛盾、部分名稱不合法、分類(lèi)系統(tǒng)和系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系不吻合等問(wèn)題，趙瑞琳?qǐng)F(tuán)隊(duì)長(zhǎng)期致力于澄清擔(dān)子菌門(mén)內(nèi)的演化關(guān)系（Zhao et al., 2017 in Fungal Diversity），并于2019年修訂了全世界最完整的擔(dān)子菌門(mén)分類(lèi)系統(tǒng)（He et al., 2019 in Fungal Diversity）。

近期，該團(tuán)隊(duì)針對(duì)擔(dān)子菌門(mén)近4年全球分類(lèi)學(xué)研究進(jìn)展，以488個(gè)物種的基因組數(shù)據(jù)為基礎(chǔ)，通過(guò)提取1764個(gè)直系單拷貝同源基因構(gòu)建擔(dān)子菌門(mén)系統(tǒng)演化基因組發(fā)育圖譜（圖1）并估算各個(gè)階元的演化時(shí)間范圍，更新?lián)泳T(mén)分類(lèi)系統(tǒng)至4亞門(mén)、20綱、77目、297科和2134屬。同時(shí)編撰了擔(dān)子菌門(mén)目等級(jí)的分類(lèi)詞典，澄清多個(gè)分類(lèi)學(xué)問(wèn)題，進(jìn)一步穩(wěn)定擔(dān)子菌門(mén)分類(lèi)系統(tǒng)。相關(guān)研究成果在中國(guó)科學(xué)院微生物所國(guó)家微生物科學(xué)數(shù)據(jù)中心相關(guān)網(wǎng)站（https://nmdc.cn/macrofungi/）同步更新，為多領(lǐng)域提供完整準(zhǔn)確的分類(lèi)信息。

圖1 擔(dān)子菌門(mén)系統(tǒng)發(fā)育基因組圖譜

該項(xiàng)研究由25個(gè)國(guó)家的93名真菌學(xué)者共同完成，中國(guó)科學(xué)院微生物研究所賀茂強(qiáng)博士后、曹檳助理研究員和劉飛助理研究員為文章共同第一作者，趙瑞琳研究員為通信作者。該研究獲得國(guó)家重點(diǎn)研發(fā)計(jì)劃項(xiàng)目（2022YFD1200605）、國(guó)家自然科學(xué)基金（32100011，31961143010，31970010）等多個(gè)項(xiàng)目支持。

供稿：曹檳